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行政機関による捕獲や駆除は行っていませんので、ご自身での対処をお願いします。
動物が嫌がる薬(忌避剤)をホームセンターで購入し、動物のいる場所に撒くことにより寄り付きにくくなります。コウモリが棲みつく場所は、屋根裏・喚起口・軒下・雨戸や瓦屋根のすきまなどが多いようですので、狭いところに対応できるスプレータイプがおすすめです。
追い払った後は、糞尿をきれいに掃除し、侵入口を塞ぐことも必要です。
ご自身での作業が難しい場合は動物の追い払いや駆除を行う業者に依頼することもできますが、市役所から特定の業者を紹介することはできかねますのでタウンページやインターネットなどでお探しいただけますようお願いします。